Znaleziska archeologiczne z południowych Stanów Zjednoczonych, Meksyku i Peru ujawniają, że kaktusy zawierające meskalinę były używane w ceremoniach przez tysiące lat. W zawartości meskaliny wyróżnia się kaktus San Pedro. Użycie kaktusa San Pedro (lub pod jego lokalną nazwą Wachuma), który był powszechny w Peru jeszcze przed imperium Inków, zostało znacznie ograniczone po podbojach hiszpańskich, ale od połowy XX wieku stopniowo rozprzestrzenił się z Peru do Boliwii i Chile, głównie jako lekarstwo.
Identyfikacja meskaliny jako substancji czynnej w kaktusie San Pedro została osiągnięta dopiero w 1960 roku. Substancja ta znajduje się głównie pod korą. Nazwa San-Pedro, którą nadano kaktusowi po hiszpańskich podbojach, odnosi się do św. Piotra, który według wierzeń chrześcijańskich dzierży klucze do bram nieba. Obecnie jest używany do podobnych celów przez Kościół rdzennych Amerykanów, który został założony pod koniec XIX wieku.
